- Sejarah Singkat Nama Sekolah PGAN Yogyakarta mulai tahun 1950-sekarang
Tahun | Nama Sekolah |
| 1950-1951 | SGAI |
1951-1954 | PGAN Laki-laki Yogyakarta. |
| 1954-1958 | PGA Atas I Laki-laki Yogyakarta. |
| 1958-1959 | PGAN Lengkap 6 Tahun Yogyakarta. |
| 1959-1978 | PGAN 6 Tahun Yogyakarta. |
| 1978-1982 | PGAN Yogyakarta. |
| 1982-1990 | PGAN Yogyakarta |
| 1990/1991 | Kelas 1 (MAN), Kelas 2 (PGAN), Kelas 3 (PGAN) |
| 1991/1992 | Kelas 1 (MAN), Kelas 2 (MAN), Kelas 3 (PGAN) |
| 1992/1993 | Kelas 1 (MAN), Kelas 2 (MAN), Kelas 3 (MAN) |
- Nama Kepala Sekolah PGAN-MAN YOGYAKARTA mulai tahun 1950
Tahun | Nama Kepala Sekolah |
| 1950-1958 | Bapak Malikus Suparto |
| 1958-1962 | Bapak Supadi Padmodarsono |
| 1962-1966 | Bapak Sutono Brotokartono |
| 1966-1974 | Bapak Drs. Sarbini Hadiwardoyo |
| 1974-1984 | Bapak Sutadji, BA. |
| 1984-1989 | Bapak Tugono, BA |
| 1989-1995 | Bapak Drs. H. Budi Sudjodo (PGAN / MAN Yogyakarta III) |
| 1995-1999 | Bapak Drs. M. Taslim (MAN Yogyakarta III) |
1999-2003 | Bapak Drs. H. Sukardi (MAN Yogyakarta III) |
2003-2008 | Ibu Dra. Sri Suwartiyah (MAN Yogyakarta III) |
| 2008-2010 | Bapak Mulyadi, S.Pd., M.A. (MAN Yogyakarta III) |
| 2010-Sekarang | Bapak Drs. Suharto (MAN Yogyakarta III) |
- Sejarah Singkat Lokasi yang pernah ditempati PGAN Yogyakarta mulai tahun 1950 sekarang
Tahun | Lokasi / Tempat |
1950-1954 | Di jalan Malioboro ( sekarang menjadi Toko Samijaya ). |
| 1954-1972 | Di jalan Ketanggungan (Mu’allimin) dan sebagian di Semaki Jalan Kapas yang sekarang ditempati SD Muhammadiyah Sukonandi dan Perpustakaan IKIP Muhammadiyah Yogyakarta. |
| 1972-1982 | Di jalan Magelang Kilometer 4 sebelah selatan TVRI Yogyakarta. |
| 1982-sekarang | Di jalan Magelang Kilometer 4 sebelah selatan TVRI Yogyakarta. |





